1.程序不同，编制单位可能不同

　　本节“环境保护”是项目建设方案设计的一部分，也就是可行性研究报告的一个组成部分，由可行性研究报告编制单位统一编制，由项目业主和/或相应的审批机构审批；而环境影响评价已单独列入我国的建设程序（与可行性研究报告并行），应由具有相应环境影响评价资质的咨询机构编制（如果可行性研究报告编制单位具有相应资质，也可能是同一个编制单位），由具有相应审批权的环境保护行政主管部门审批。

　　2.内容不尽相同

　　本节“环境保护”重在研究确定项目产生的污染物和污染源，并研究提出适当的治理措施，达标排放；而环境影响评价主要在于评价治理措施是否可行，经治理后项目对环境产生的影响大小，是否满足总量控制和有关标准的要求。进而做出环境影响评价结论。

　　3.作用不同

　　本节“环境保护”是构成项目建设方案的必要组成部分。按照有关法规，可行性研究报告必须包含环境保护章节，缺乏环境保护内容的可行性研究报告是不完整的，不可能得到批准；而环境影响评价文件是环境保护行政主管部门审批项目的依据。

　　虽然两者存在明显的区别，但也有内在联系。两者都基本遵循同样的法规和标准，都要从环境现状开始进行调查研究。而且两者具有互为依存的关系，环境影响评价的工程分析基于项目的方案设计，同时项目方案设计的治理措施方案又应该落实环境影响评价所提出的要求。