系统设计作业的任务是要求对系统研究作业所限定的系统环境、决策系统和目标的特征进一步结构化，同时采用合理的、合乎逻辑的设计过程和方法反映系统的行为特征及效果，并利用与信息源内容相关的各类专业知识充分和有效地扩展和掌握信息源的可知部分，以达到使信息源的不可知部分减少到最低限度的目的。系统设计时要考虑系统的准确性和可操作性两个原则。

系统设计的目的在于反映现实系统环境因素及系统结构对于目标效果的影响。结构化系统可以应用硬系统思维过程的思路进行分析和描述，非结构化系统则要用软系统思维过程来处理。

系统设计的可信度鉴定可以从两方面进行。一方面是从系统的解析水准观念来鉴定；另一方面是从系统的基本特征或结构来鉴定。

系统设计作业完成以后，便展示了系统目标覆盖范围内的各个系统部件以及部件之间的关系组合，描述了系统环境、决策系统与目标之间的相互联系和影响，建立了系统数据流图和系统结构图等，这两个阶段的工作是以方法论和思维逻辑性的工作为主。