逻辑框架的逻辑关系分为垂直逻辑和水平逻辑。垂直逻辑关系，即因果关系，从下往上或从上往下进行四个层次的分析，其中关键在于层次纲要与假定条件的关系分析；水平逻辑主要是指验证指标和验证方法。

1.垂直逻辑的因果关系

在逻辑框架法中 “垂直逻辑（VertiCAl LogiC）”可用来阐述各层次的目标内容及其上下间的因果关系

2.重要的假定条件（ImportAnt Assumptions）

在逻辑框架的4个目标层次之间有一些重要的限制条件，称为假定条件，即必要的外部条件或风险。重要的假定条件主要是指可能对项目的进展或成果产生影响,而项目管理者又无法控制的外部条件，即风险或限制条件。这种失控的发生有多方面原因，首先是项目所在地的特定自然环境及其变化。其次，政府在政策、计划、发展战略等方面的失误或变化给项目带来了严重的影响。第三个不确定因素是管理部门体制所造成的问题，使项目的投入产出与其目的目标分离。

3.水平逻辑关系

逻辑框架的垂直逻辑分清了评价项目的层次关系，但尚不能满足对项目实施分析和评价的要求。水平逻辑分析的目的是通过主要验证指标和验证方法来衡量一个项目的资源和成果。对应垂直逻辑每个层次目标，水平逻辑对4个层次的结果加以具体说明。水平逻辑关系则由验证指标、验证方法和重要的假定条件所构成，形成了逻辑框架法的4×4的逻辑框架。