1、宏观性

水利工程对生态环境影响后评价具有宏观性。由于水利工程在占地规模上比较大，所包含的事物也就千奇百怪，在进行评价的过程中，也就不会在芝麻细节上花费太多功夫，还是将主要的精力放在了宏观陛上，把握住整体的性质，也就把握住了评价的主体，这样就能在评价过程中合理科学的进行评价工作。

2、复杂性和广泛性

水利工程对生态环境影响后评价不免比较复杂和广泛。由于水利工程对于生态环境的影响是方方面面的，就原因的分类上就有几十上百种，再加上其他的因素，使得在评价过程中，不可能只局限于某一个范围，必然是比较广泛，并且不可能做到简单明了，会比较复杂难懂。

3、战略性

水利工程对生态环境影响后评价具有战略性。由于在评价水利工程对生态环境的影响的原则中有战略性原则这一条，因此在评价特点上也就会凸显出战略性，这主要是国家政府的战略意图的体现，一般来说难以改变。

4、不确定性

水利工程对生态环境影响后评价具有不确定性。在评价的过程中，每个因素都是瞬息万变的，每个人在进行评价的时候，所观察的东西都是不同的，这就导致在评价结果上有些地方显得模棱两可。比如在评价三峡水电站的时候，对于发电而言，对于中国的经济发展起了推动作用，但是在气候，土壤，地质地形上却发生了很大的改变，这些因素都是不确定的，无法用同一标准进行衡量，这就导致在评价水利工程对生态环境影响的过程中往往无法确定。