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1、持续发展的原则

从治理环境的角度来看．持续发展就是利用生态化的措施来治理水环境，以此获得对生态系统的可持续开发和最大保护。所以可以通过合理选择和设计水电站的位置来保护水环境，做到从立项开始就注重对水环境的保护协调整个水系的生态环境．将开发和保护紧密结合起来。

2、预防为主治理为辅

水电站建设主要影响的是水质的改变．如果可以保证水源地的水质质量就可以有效的对污染进行稀释和缓解。所以应该把整个水系看做是一个统一的整体，将水电站建设作为水环境处理的核心来对水体质量进行宏观的监控．即将水源和下游工业开发有机的结合起来．一方面要合理控制对下游的过渡开发，另一方面，要严格保护水源地的水量和质量．进而才能有效保证水环境的相对平衡．合理消除水电站建设所带来的负面影响。

3、引入公共监督的原则

在水电站建设过程中．要建立科学合理的监督机制，科学合理的监督可以有效控制大范围的环境污染．所以在保证水环境质量的过程中，应当引入科学合理的监督机制。积极发动群众的力量来进行环境监控之所以引入公众参与对水环境的监督和保护，主要就是为了使公众有权对水电站建设及其环境污染的情况进行监督，即全面监督水电站建设过程的开发、利用、治理、管理等决策，也就是使水电站建设和开发的过程及影响透明化，通过公众监督来防止决策的盲目性对水电站建设的效益和破坏性失去平衡．最大限度的来保护水环境的质量。