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1、工程技术落后、标准低。国内各地多数地区农田水利工程大多是上个世纪六、七十年代修建的，那时的设计标准低、技术含量不高，随着时代的发展、社会的不断进步，农田水利工程早已出现老化、失修，而且情况较为突出严重，根本无法满足现代农业生产的需要。

2、工程质量差、缺乏完善的建设制度。由于历史等诸多原因影响，我国各地区存在着农田水利建设制度尚不够完善，监督、监控、管护措施以及检查方式存在着漏洞与不足。在此情况下容易造成工程质量问题尤其是在对小型农田水利工程的监测时，常常是采取目测检测来完成，缺少必备的监测仪器及监测设备。而且各地区基层缺少专业的专业监测人才，在一定程度上都直接影响了农田水利工程的建设质量。

3、农田水利基础设施不足。我国各地农田水利工程在面对季节性缺水、降雨频发等自然灾害的能力还比较薄弱。水利工程数量比较缺乏，工程的完好率也相对较差，导致部分地区的水利工程排挡能力不足，直接影响对农田的灌溉及排涝性能。尤其是今年西南地区大面积的干旱、东北地区大面积的洪涝灾害，导致部分地区农田绝产、颗粒无收，为我们敲响了警钟。

4、资金投入不足，建设缓慢。近年来，国家加大了对农村水利工程建设的资金投入及管理扶持。但因部分地区、尤其是偏远的、经济欠发达地区，基础差，底子薄，对农田水利工程建设的投资严重不足，使建设工作长期处于停滞状态，而且对于原有的农田水不工程也无法做到及时进行维修、管护，出现了损毁较为严重的现象，形成恶性循环。严重制约了当地农业生产，阻碍了农业经济的可持续发展。