建立健全农田水利基本建设投入机制。农田水利基本建设所需的巨额投资，无论靠国家、集体或农民个人的单方面努力都是难以承载和筹集的，必须逐步建立起“政府投入为主导、农民自愿投入为基础、其他社会投入为补充”的多层次、多渠道、多元化的新型农田水利基本建设投入机制。

　　（1）充分发挥财政资金的导向功能。

　　当前及今后相当长一段时期内，在国家财力不足的情况下，必须充分利用财政资金的导向功能，采取财政补贴、低息、定向定额补贴、税收优惠、民办公助、以奖代投等多种方式，引导集体、农民及全社会资金增加对农业基础设施的投入。要积极引入市场机制，激活水市场，努力营造一种社会各界办水利的良好氛围，吸引各方投资，利益共享，多渠道、多层次地增加农村水利基本建设的投入。

　　（2）凝聚支农资金合力。

　　在财政扶贫资金、国债资金、小型农田水利补助、以工代赈、农业综合开发资金和水利建设资金等资金的管理方面，要改变过去那种计委管水利、扶贫办也管水利、农业开发等也管水利，资金使用管理严重分散、投资低效的做法，把以上用于农田水利基本建设的资金集中起来捆绑使用，由财政和水利部门集中统一管理，以有效杜绝农水扶持资金管理上的跑、冒、滴、漏，并能够集中力量办大事。

　　（3）不断完善“一事一议”筹资投劳制度。

　　要解决好我国农田水利基本建设历史欠账多、筹建任务重、资金缺口大这一历史难题，就必须在：不断加大各级财政投入力度的同时，通过“一事一议”制度为农田水利建设筹资投劳。各级政府应首先明确农田水利建设对农民筹资投劳的性质，是属于农业生产成本范畴，农民是直接受益：者，只要是在区域范围内农民自愿、公平分摊的原则下确定的，都应视为合理负担，不能与加重农民负担相提并论。但政府部门要严格掌握农民筹资投劳的额度，不能超过当地农民的承受能力。在“一事一议”具体实施上，应由村民代表：提出建设项目，村委会讨论形成意见，交村民大会形成决议并付诸实施。用民主的方式组织农田水利基本建设筹资投劳，把一家一户办不了、办不好的事情变为现实。对通过“一事一议”所筹集的资金，应成立由村民代表参加的村民理财小组进行管理，实行民主管理、账务公开、村民监督，从而确保“一事一议”筹资投劳的透明、民主化管理和有效缓解农田水利建设资金严重不足的压力。