环境影响评价，实际上就是按环境科学观点及其相关的价值取向，就工程项目影响引起的自然生态、社会生态和环境的价值变化，进行评判、预断。

1、工程的价值评价

对于许多属于无价之宝的自然、风光、文物、物种等的影响评价，应明确其价值取向，使之可以定量及定性评价，使本该受到十分重视的问题，给以应有的地位。

另外要对工程价值的时效性进行评价，如现有的工程所具有防洪、发电的功能和价值，几十年后则其功能可能为其上游、支流众多工程所代替，其在流域、区域或全国中的价值地位会相应降低。总之，价值的大小取决于客体对主体的满足程度。

2、环境影响的经济评价

工程引起的资源和环境变化，应作为人类社会经济发展的一个成本因素、经济因素加以评价大型水利工程引起广泛的生态与环境变化。对其有利影响，如何发挥其更大的经济效益；对其不利影响，如何进行投资治理，投资治理后能达到什么样的环境状况，恢复到什么样的水平，产生什么样的治理效益，在此基础上，再进一步确定投资目标、投资方向、投资项目和投资区域，力图达到优化的投资效果。

3、风险分析评价

实际上，每一大型水利工程都存在着某些不确定的风险因素，不冒一定风险的工程是不存在的。工程风险存在的几率虽然很低，但一旦发生，则可能造成严重的生态与环境后果，为了做到有备无患，水利工程环境评价的风险分析评价是至关重要的。

4、长期跟踪评价

大型水利工程对生态与环境的影响是长期的，潜在的，许多问题特别像河口生态、库区生态、水生生态系统的结构，功能和效益的变化，不是短期能明了和掌握的，只有长期的监测、观察、研究，才能逐步找出规律，因此，环境影响评价不能以工程通过可行性论证为终点。